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高野山内の重要な文化財を保存、展示する施設として、有志者の寄附と金剛峯寺によって大正10年(1921年)に開設した。大江新太郎氏が設計した本館は、木造博物館施設としては日本最古の建造物で、登録有形文化財となっているが、現在も展示施設として利用されている。春は石楠花(しゃくなげ)、秋は紅葉のスポットとしても有名。石楠花の開花は例年5月上旬、紅葉は例年11月上旬が見頃。