石山寺境内には、庭木風に手入れされた「薫の苑」、高低差が活かされた「東風（こち）の苑」、梅の自然な姿が楽しめる「第3梅園」の3つの梅園があり、例年2月中旬から3月中旬にかけて、紅梅や白梅をはじめ寒紅梅、長束など約40種400本が咲き誇ります。2月18日から3月18日は、境内で「梅つくし」が開催され、盆梅が展示されます。