収穫に感謝し、長く寒い冬の間の健康や火災除けを願う神事「火焚祭」が、新日吉神宮で執り行われます。「火焚祭」は、京都の多くの神社で行われる秋の行事として知られ、大正時代までは、皇室でも皇居において天皇の御前で女官により行われていました。新日吉神宮では、午後3時からの本殿での祭典で、神楽女により優雅な「鈴の舞い」と「剣の舞い」が奉納され、その後、本殿前の火床で火焚串の焼納や、湯立神楽が厳かに舞われます。火焚の炎にあたると健康に恵まれるとされ、参拝者へは風邪よけの「焼みかん」と災難不浄除けの「笹まもり」が無料で配られます（いずれも数に限りがあり）。